Mega Man Zero 4 é um videogame criado pela Capcom e Inti Creates para o Game Boy Advance em 2005. É a quarta e última parcela da série Mega Man Zero, tornando Zero a primeira subsérie Mega Man a ver uma conclusão adequada. O jogo apresenta o Zero Knuckle, uma arma que permite que Zero roube as armas de outros inimigos e as use para si mesmo, bem como uma nova mecânica onde Zero pode alterar as condições climáticas antes de entrar em um dos oito níveis principais.

Mesmo com a morte de Omega no último jogo, a Dra. Weil ainda é a líder indiscutível da Neo Arcadia. Com seu governo de punho de ferro, humanos e Reploids estão agora sob opressão. O jogo começa com uma Caravana humana escapando do que já foi sua casa, sendo perseguida por um novo tipo de soldados inimigos, a Variante. Zero e a Resistência se juntam à perseguição, lutando contra as Variantes e salvando os humanos. Ciel e Zero encontram o líder da Caravana, Neige, que lhes conta sobre a situação atual em Neo Arcadia, e que agora ela está liderando seu grupo para a Área Zero, onde um assentamento humano foi estabelecido. O comboio da Resistência segue a Caravana para a Área Zero. Explorando o habitat, Zero logo encontra os Oito Guerreiros Einherjar e seu líder, Craft. Através deles, Zero aprende sobre a Operação Ragnarok, uma operação militar em que Weil planeja destruir todos os lugares habitáveis, como a Área Zero, para que os humanos parem de fugir de Neo Arcadia. Os Einherjar e a Arte são os únicos que executarão este plano, pensando que os humanos são tolos em pensar em fugir do governo de Weil.