Ano 2011. Cinco anos se passaram desde o Segundo Desastre, que eclipsou os eventos de abril de 1986. A Zona é abalada por explosões frequentes e poderosas, que movem campos de anomalias, abrindo novas rotas para locais anteriormente inacessíveis. Facções espreitadoras lutam pelos novos territórios e pontos-chave. Muitos perseguidores morrem, mas os novatos continuam chegando. A ação ocorre um ano antes dos eventos de S.T.A.L.K.E.R.: Shadow of Chernobyl, um ano antes da viagem mais bem-sucedida de Strelok ao centro da Zona – a terceira. Você aprenderá sobre Strelok e seu esquadrão do ponto de vista de outro personagem. A Zona está esperando por você à frente, novos locais e ameaças desconhecidas, buracos espaciais e monstros escondidos na névoa, noites escuras como breu e raios salvadores de um sol nascente. Tente evitar anomalias e se esconder de explosões, descubra a Zona e colete artefatos, cure a irradiação radioativa e lute por qualquer facção perseguidora que você goste! Só então você descobrirá a verdade sobre Strelok e como ele entrou no caminhão da morte e recebeu o S. T. A. L. K. E. R. tatuagem no braço.

Uma prequela de S. T. A. L. K. E. R. : Sombra de Chernobyl, Céu Claro retorna à Zona, o perigoso território proibido ao redor da Usina Nuclear de Chernobyl, onde mutantes, anomalias mortais e facções itinerantes de necrófagos conhecidos como Perseguidores competem pela sobrevivência e pelos artefatos inestimáveis que a região produz. O jogador assume o papel de Scar, um mercenário endurecido que sobrevive a uma emissão catastrófica de energia letal e é levado pela facção científica chamada Clear Sky. Alinhado com esse grupo, Scar recebe uma tarefa perigosa: rastrear e impedir que um bando de Stalkers se aproxime cada vez mais do coração da Zona, uma incursão que ameaça desestabilizar o frágil equilíbrio de toda a região. Enquanto ele se aventura por pântanos perigosos, assentamentos em ruínas e campos de batalha contestados, Scar se envolve nas guerras de facções em andamento que dominam a Zona. Sua busca gradualmente se concentra em uma única figura indescritível, o Strelok Perseguidor, cujas ações estão no centro da crise que se desenrola.