Nesta sequência de SNES dos jogos de tiro arcade R-Type, você é o R-9, a forma mais avançada de defesa da Terra contra o maligno Império BYDO. Existem sete estágios pelos quais você deve passar, pegando itens de energização para derrotar os chefes de estágio que retornaram das versões arcade de R-Type e R-Type II. Sua nave R-9 também pode ser unida com FORÇA, que são unidades invencíveis que cercam sua nave para protegê-lo e também podem ligar e atacar.