A série clássica dá um salto à frente na apresentação visual em Mega Man 11 com uma direção de design 2. 5D introduzindo personagens e ambientes bonitos e completamente desenhados à mão. Um Mega Man redesenhado assume o Dr. As máquinas furiosas de Wily, derrotando chefes Robot Master e pegando suas armas, em uma luta em constante evolução por justiça com novos e únicos designs inimigos.

Depois de completar sua pesquisa proibida no Sistema de Equipamento Duplo, o malvado Dr. Wily transformou robôs outrora pacíficos em seus capangas destrutivos! No entanto, a história do Sistema de Engrenagem Dupla é mais do que parece. Originalmente projetado para empurrar os robôs além de suas limitações, o dispositivo de Wily foi considerado muito perigoso e sua pesquisa foi interrompida. Recordando o incidente anos depois, Wily completou seu dispositivo e agora busca vingança. Com nada além do Dr. Protótipo de Equipamento Duplo de Light, Mega Man tem a força necessária para acabar com a rivalidade?