Neste jogo de ação baseado na franquia de brinquedos, você joga como um menino chamado Yamato que ama suas máquinas B-Daman mais do que qualquer coisa. Você se enfrentará em batalhas B-Daman com os rivais de Yamato, fazendo uso de ataques especiais para sair vitorioso. Ao longo do jogo, você personalizará suas máquinas e aumentará o Yamato. Yamato também encontrará personagens familiares e desconhecidos em suas jornadas, incluindo o caloroso Alan e o sinistro Duende. Apenas alguns têm o que é preciso para se tornar um B-Daplayer; Yamato se tornará o B-Dachampion?