Como seu antecessor, Stakes Winner 2 é um jogo de corrida de cavalos 2D. Escolhendo entre uma das seleções de cavalos do jogo, os jogadores devem competir em uma série de corridas em pistas diferentes para ganhar dinheiro e prestígio. Cada cavalo que os jogadores podem selecionar é classificado de acordo com a velocidade, resistência e explosão. Os jogadores controlam seus cavalos com o joystick e três botões. Pressionar o botão A repetidamente mantém o cavalo acelerado com um leve dreno da barra de resistência, enquanto pressionar o botão B aplica o corte do cavaleiro ao cavalo. Isso resulta em uma leve explosão de velocidade ao custo de drenar a barra de resistência do cavalo mais rapidamente.