No Sanctum 2, você terá que utilizar elementos de vários gêneros de jogabilidade para ter sucesso. Construa torres e muros durante a fase de construção antes que os inimigos ataquem, depois entre na briga e ajude suas torres a destruir tudo em pedaços no modo FPS. Você pode progredir na campanha para um jogador ou jogar em modo cooperativo para até 4 jogadores com seus amigos para descobrir os segredos do planeta LOEK III e por que os alienígenas estão tão determinados a destruir os Núcleos que você jurou proteger.