O SOCOM II é um jogo de tiro tático em terceira pessoa. Existem 12 missões single-player diferentes: divididas igualmente entre Albânia, Argélia, Brasil e Rússia. Existem cinco graduações diferentes que podem ser jogadas no jogo: Alferes, Tenente, Comandante, Capitão e Almirante. O jogador começa com as três primeiras fileiras desbloqueadas, mas deve terminar o jogo para um jogador no Comandante para desbloquear o Capitão e no Capitão para desbloquear o Almirante. Os jogadores podem desbloquear novos modelos para multijogador, bem como filmes, música, arte conceitual e créditos ao completar certos objetivos.

SOCOM II: US Navy SEALs coloca os jogadores no comando de um esquadrão de elite da MARINHA dos EUA que realiza operações militares secretas em todo o mundo. Em uma série de missões tensas, a equipe é enviada para pontos problemáticos na Albânia, Argélia, Brasil e Rússia para enfrentar insurgentes armados e forças terroristas. O sucesso depende de discrição, precisão e estreita coordenação com outros agentes no campo. Cada desdobramento encarrega o pelotão de completar objetivos críticos enquanto desliza por território hostil.