Aproveitando o poder do Nintendo 3DS, os jogadores podem se soltar em cada novo mundo vibrante enquanto se revira e gira, com o objetivo de coletar todas as bananas no menor tempo possível. Esta última edição contém três novas opções de jogabilidade, incluindo níveis de quebra-cabeça para um jogador, Monkey Race e Monkey Fight. Esses novos modos de jogo dão aos jogadores a chance de competir via conexão sem fio com até quatro jogadores na melhor experiência social 3D possível na palma de suas mãos. Além disso, os fãs do Super Monkey Ball poderão escolher entre o sensor de movimento do Nintendo 3DS ou o Slide Pad para navegar pelos labirintos do quebra-cabeça com total precisão.