Em uma pequena vila pré-histórica, o desastre aconteceu! O estoque de comida de inverno foi comido por dinossauros ganciosos e os aldeões estão enfrentando a fome! O Chefe da Vila escolheu Sam para salvar a humanidade liderando uma jornada para encontrar o lendário Cemitério de Dinossauros. Sam deve cruzar muitas terras pré-históricas desconhecidas e trazer ossos valiosos suficientes para comprar toda a comida de que os aldeões precisam para sobreviver ao inverno.

Prehistorik Man, assim como seu antecessor, se passa na Idade da Pedra. No meio da noite, dinossauros gulosos roubam toda a comida de uma pequena aldeia. Com a chegada do inverno e os habitantes da aldeia enfrentando a fome, o Chefe da Aldeia convoca Sam, um jovem e ágil aldeão, e o encarrega de conseguir comida para ajudar a aldeia a sobreviver ao rigoroso inverno.