O oceano está repleto de vida. Centenas de espécies da vida real estão lá para serem descobertas, de cavalos-marinhos a baleias gigantes. Os peixes locais estão doentes ou agitados? Os jogadores podem visualizar seu estado de saúde e, em seguida, usar uma ferramenta semelhante a um tranquilizante para eliminar os que precisam de reabilitação com energia de cura. O jogo também inclui um enredo que os jogadores podem seguir como quiserem. O enredo envolve Oceana, uma mulher que investiga o ? Canção do Dragão, que seu pai, um proeminente explorador oceânico, estava procurando pouco antes de sua morte. Enquanto estiverem na Ilha Nine Ball, os jogadores podem se tornar amigos de um golfinho e ensinar-lhe alguns truques novos. Ao mergulhar, os jogadores podem até trazer o golfinho, que os jogadores podem segurar para nadar mais rápido. Pela primeira vez na série, os amigos que têm acesso à Internet de banda larga podem se conectar e mergulhar uns com os outros via Nintendo Wi-Fi Connection, enquanto usam o microfone Wii Speak ® para conversar.