Star Control é um jogo de guerra de ficção científica que coloca as forças da Aliança das Estrelas Livres contra as da predatória Hierarquia Ur-Quan. O jogo foi projetado para que você possa entrar facilmente no jogo, familiarizando-se com menus, opções e controles do jogador. A Aliança e a Hierarquia possuem sete tipos diferentes de navios de guerra. Cada embarcação tem suas próprias características de manobra e disparo, além de um poder especial único que você pode empregar quando as circunstâncias determinarem. A humanidade está prestes a ser varrida da face do mapa galáctico. Um grupo selvagem de raças alienígenas chamado Ur-Quan Hierachy tornou-se o "império do mal" do século 27 - invadindo impiedosamente os vizinhos interestelares. A humanidade é a próxima em sua lista. Seu trabalho é garantir que eles não tenham sucesso. Toda a frota de batalha da Aliança das Estrelas Livres aguarda suas ordens.