Dai-3-ji Super Robot Taisen ("3rd Super Robot Wars") is the third game in Banpresto's immense Super Robot Wars/Taisen series. Six months after the DC War (as chronicled in Super Robot Wars 2), the DC seems to be regaining their former combat strength thanks to the Zabi family. In response, the United Nations has decided to reorganize itself into the Earth Federation.

A história começa seis meses após a guerra contra os Cruzados Divinos (DC) em Super Robot Wars II. A guerra deixou o mundo em um grande estado de desordem e caos, e as Nações Unidas estavam impotentes. Para resolver a crise, foi criada a Federação da Terra, em substituição às Nações Unidas. Os membros da Base Branca foram reunidos e encarregados de manter a paz, mas apenas equipamentos antigos foram fornecidos a eles devido à falta de energia disponível. Enquanto a Terra parecia pacífica por um tempo, casos de desaparecimentos repentinos de tropas federais começaram a ocorrer com frequência, e Londo Bell recebeu ordens para investigar. Originalmente, acreditava-se que os remanescentes da DC eram responsáveis, mas mais tarde descobriu-se que a verdadeira razão por trás dos desaparecimentos era uma ameaça do espaço sideral, uma invasão alienígena como Bian Zoldark temia que pudesse ocorrer. Uma nova guerra começa, com as tropas de Londo Bell lutando contra DC (agora liderada pela família Zabi) e as forças alienígenas.