Faça parte da aventura animada da Dreamwork guiando Marty, a Zebra, Alex, o leão, Melman, a girafa, Gloria, o hipopótamo e aqueles pinguins furtivos enquanto escapam do Zoológico do Central Park para as ruas de Nova York e depois para a selva selvagem...errar zoológico de San Diego. O enredo é exatamente o mesmo do filme em si e cada capítulo o levará mais longe na história. Cada capítulo terá vários objetivos definidos. Apenas um objetivo específico por capítulo é necessário para concluir o capítulo, para que você possa sempre repetir o capítulo mais tarde para tentar concluir todos os objetivos. Cada estágio também exigirá que você jogue como um personagem diferente e alguns envolverão todos os personagens. Cada personagem tem suas próprias habilidades únicas: Marty pode chutar com as patas traseiras, esgueirar-se em torno de seus inimigos deslizar e realizar saltos longos. Alex, o leão, pode jogar frutas, usar suas garras e rugir para seus inimigos. Gloria pode cair, pular de bunda e checar seus inimigos. E quando ela comer algumas pimentas, ela será capaz de atacar seus inimigos. Melman pode girar, jogar itens e bater na cabeça de seus inimigos. Ele também pode realizar o movimento do Helicóptero, o que lhe permite deslizar longas distâncias. Finalmente, o Pinguim pode deslizar, pescar e atacar com um movimento de Finalização (algo como uma costeleta de karatê) para derrotar seus inimigos. Ao longo do jogo, haverá vários itens para coletar, incluindo Life Tikis para reabastecer seu Medidor de Saúde e Dinheiro de Macaco, que permitirão que você compre coisas especiais na Loja Zoovenir, como minijogos e roupas especiais para o elenco de Madagascar.