Prince of Persia 2: The Shadow and the Flame é um jogo de plataforma lançado como a sequência de Prince of Persia de 1989. Prince of Persia 2 foi publicado para MS-DOS e portado para Macintosh, Super NES e FM Towns – uma lista muito mais curta de plataformas do que o primeiro jogo. Também estava disponível como um bônus que é desbloqueado na versão Xbox NTSC de Prince of Persia: The Sands of Time.

O jogo acontece onze dias após os eventos do primeiro jogo. Durante este período, o Príncipe foi saudado como um herói que derrotou o maligno Jaffar. Ele recusa todas as riquezas e, em vez disso, pede a mão da princesa em casamento como sua recompensa, com a qual o sultão da Pérsia relutantemente concorda. O jogo começa quando o Príncipe entra nas cortes reais do palácio. Antes de entrar, sua aparência se transforma na de um mendigo. Ninguém o reconhece, e quando ele tenta falar com a Princesa, um homem que compartilha sua aparência (Jaffar, que está magicamente disfarçado) emerge das sombras, ordenando que ele seja expulso. Com guardas o perseguindo, o príncipe salta por uma janela e foge da cidade por meio de um navio. Adormecendo no navio, o príncipe sonha com uma mulher misteriosa que pede ao príncipe que venha até ela. Neste momento, o navio é atingido por um raio, lançado por Jaffar. Quando o príncipe recupera a consciência, ele se encontra na costa de uma ilha estrangeira. Ele chega a uma caverna cheia de esqueletos humanos reanimados que lutam contra ele. Ele finalmente escapa em um tapete mágico. Enquanto isso, na Pérsia, Jaffar toma o trono sob o disfarce do príncipe. A princesa adoece sob o feitiço de morte gradual de Jaffar. O tapete mágico leva o príncipe às ruínas de uma cidade antiga cheia de fantasmas gritantes, cobras e armadilhas. Chegando ao que parece ter sido uma sala do trono, o príncipe perde a consciência e a mulher misteriosa, revelada como sua mãe, aparece novamente. Ela explica que o Príncipe é de uma linhagem real e o único sobrevivente do massacre por "exércitos das trevas". Ela implora para que ele vingue os caídos. O Príncipe monta um cavalo mágico até um templo vermelho, habitado por monges guerreiros usando cocares de pássaros. Lá, ele descobre que a sombra, criada nos eventos do jogo original, agora pode deixar seu corpo à sua vontade. Ele empunha sua sombra para obter a chama mágica do templo, momento em que os guerreiros pássaros se ajoelham diante dele. Ele voa de volta para a Pérsia no cavalo mágico e confronta Jaffar. Com a sombra e a chama, o príncipe queima Jaffar, matando-o para sempre. Com o feitiço de Jaffar quebrado, a princesa acorda. O príncipe ordena que as cinzas do ex-vizir sejam espalhadas. O jogo termina em um suspense quando uma velha bruxa é mostrada observando o casal feliz através de uma bola de cristal. De acordo com Jordan Mechner, a trama da velha bruxa e dos "exércitos das trevas" deveria ser resolvida em uma sequência, que nunca veio.