Ao contrário da maioria dos jogos de Final Fantasy, Dissidia é mais um jogo de luta do que um RPG clássico. Ele ainda mantém a história complexa, o nível do personagem e a personalização. O jogo apresenta personagens principais dos outros títulos de Final Fantasy, dois de cada título (o protagonista e o antagonista). A trama gira em torno da batalha dos dois deuses, Cosmos e Caos. Os protagonistas formarão equipes para lutar contra os exércitos do Caos e encontrar seus cristais que mais tarde serão usados para destruir o Caos. Cada personagem tem sua própria campanha para passar no final da qual um cristal será coletado. O jogo também apresenta uma única luta e um modo arcade, onde o jogador poderá escolher seu lutador e o oponente (os oponentes são escolhidos automaticamente pelo jogo se jogarem no modo arcade). Toda a experiência e perícias do personagem recebidas através da campanha são salvas para os outros modos de jogo (e vice-versa, por exemplo: se Cloud tivesse um nível igual a 12 ao completar a campanha, ele também pareceria ter o mesmo nível ao vê-lo na lista de personagens no Arcade ou Modo Batalha Rápida). Outra característica é que os itens que você encontra durante a campanha pertencem a você, o jogador. Isso significa que você pode mover itens de um personagem para outro. O jogo também apresenta conteúdo extra, como vilões, fantasias, etc., que podem ser desbloqueados usando PP. Você ganha esses pontos em cada luta e campanha concluída.