Tendo como pano de fundo uma tempestade catastrófica que assola a cidade de Nova York, Overclocked explora uma condição arquetípica, mas real, da humanidade: a violência. Este thriller psicológico mistura elementos assustadores de suspense fictício usando estruturas narrativas inovadoras. O overclock mapeia as áreas difusas onde memórias e ilusões; sonhos e realidade; perpetradores e vítimas; colidem. O psiquiatra do Exército, David McNamara, é chamado ao Hospital Forense de Staten Island, em Nova York, para consultar sobre um caso que requer sua experiência em psiquiatria forense. Com a tarefa de explorar as mentes de cinco jovens homens e mulheres que foram encontrados assustados, gritando e sem memória, ele faz descobertas alarmantes quando começa a explorar cautelosamente a psique de seus jovens pacientes. Ao longo do jogo, os jogadores alternarão entre seis personagens diferentes neste arrepiante thriller psicológico interativo.

O jogo começa quando cinco adolescentes amnésicos em idade universitária aparecem de repente com armas no meio da cidade de Nova York. O psiquiatra David McNamara, de DC, é enviado para examinar o caso graças ao seu trabalho anterior no Exército dos EUA lidando com transtorno de estresse pós-traumático. Desde o início, o caso parece estranho. No primeiro dia, David descobre que todos os cinco pacientes tinham as mesmas origens e estavam escapando da mesma pessoa desconhecida de uma ilha militar isolada. À medida que a história é revelada, David, usando um PDA como gravador, percorre a mente dos adolescentes, reunindo sua história e, ao mesmo tempo, lidando com seu divórcio em andamento. O próprio David tem sérios problemas em relação ao controle da raiva, o que encerrou seu antigo relacionamento. É revelado no final que os adolescentes faziam parte de um experimento militar para fazer assassinos amnésicos, e os problemas de raiva de David eram apenas efeitos colaterais do projeto anterior no Exército.