O planeta Ranax está sob ataque do maligno império Maaron. O último soldado ranaxiano deve encontrar e usar um código digital para desligar o satélite de controle mental do império. Rebel Runner - Operation: Digital Code é um jogo de arcade onde o personagem principal atira bolas de fogo de suas mãos em inimigos extraterrestres, enquanto cruza níveis 3D pré-renderizados. O personagem é controlado pelo teclado (botões padrão: CTRL para disparar e Alt para pular) ou pelo joystick. Cada estágio começa com três vidas e o jogo salva o progresso entre os níveis.