Em SD Gundam Battle Alliance, Mobile Suits e personagens de toda a história de Mobile Suit Gundam ocupam o centro do palco neste novo RPG de ação.

A história se passa em G: Universo, um mundo onde o cânone de Gundam se transforma de maneiras que ninguém pode prever. Para corrigir a história distorcida deste mundo, o jogador lidera um esquadrão de 3 unidades composto por Mobile Suits e pilotos de toda a história de Gundam – uma verdadeira Aliança de Batalha. O que espera além da falsa história...