Puzzles for Clef é um jogo de aventura relaxante focado na heroína de mesmo nome. Seguindo uma carta de sua irmã, Cres, nossa amiga coelhinha Clef viaja para a ilha de seus ancestrais, para realizar uma caça ao tesouro. A jornada a levará por uma terra de beleza, magia e mistério, enquanto ela explora cada uma das regiões da ilha, resolve seus inúmeros quebra-cabeças, desvenda segredos há muito esquecidos e redescobre o legado de sua família.