Mortal Kombat: Armageddon se gaba de uma lista de 62 personagens e vê o retorno dos clássicos do Mortal Kombat original, como Reptile, Shang Tsung e Goro. O modo Konquest aprimorado (modo história/aventura) melhora em relação às versões anteriores, mas tem uma duração mais curta. Agora existem 64 arenas (incluindo versões renovadas de ambientes clássicos), cada uma com seus próprios ajustes, como a quantidade ridícula de fatalidades de palco (fatalidades são uma maneira sofisticada de matar seu oponente, incluindo técnicas clássicas como a "quebra de coluna" ou "quebra de braço").

Em todo o universo de Mortal Kombat, os guerreiros estavam ficando fortes e numerosos demais para os reinos lidarem. Os poderes dos guerreiros ameaçam destruir completamente o tecido do universo MK. Absolutamente, todos os guerreiros que eram bons, maus ou neutros lutavam entre si em uma única batalha real que ameaçaria destruir a realidade. Sem aviso, uma pirâmide se ergue do chão e a ponta explode em chamas, atraindo a curiosidade dos guerreiros para ver o que era. Todos lutaram entre si para chegar ao topo, enquanto Blaze se revelou aos combatentes. A geração de fogo foi criada pelos Deuses Anciões para destruir o maior número possível de lutadores, a fim de salvar os reinos do Armagedom. Esta seria a última batalha dos guerreiros, sua última chance de provar que são dignos de sobreviver, enquanto muitos outros perecerão. Esta será a batalha final para Mortal Kombat, a batalha que determinará o destino dos reinos...