Dawn of Mana, como o título sugere, concentra-se nas origens da série de RPGs de ação Secret of Mana da Square, abordando a gênese da Árvore de Mana e da Espada de Mana. O jogo se passa na outrora idílica ilha chamada Illusia, onde a Árvore de Mana, que dá vida, secou e se transformou em pedra. Na necessidade desesperada de um herói, Illusia chama um dos seus para salvar a terra de uma terrível ameaça. Os jogadores guiarão este jovem guerreiro em uma missão épica que os fará se aventurar em um mundo completamente 3D pela primeira vez na série. De planícies majestosas a montanhas imponentes, os ambientes interativos em Dawn of Mana oferecem uma variedade de lugares para visitar, personagens para conhecer e criaturas para lutar. O sistema de combate mais uma vez se desenrola em tempo real, com jogadores capazes de pular, cortar com uma espada, disparar projéteis e até mesmo balançar um chicote que pode se prender a objetos.