Tantei Bokumetsu é um jogo de aventura de simulação de detetive em que 14 detetives enfrentam um assassino em série. Cada personagem é membro da "Aliança de Detetives", uma organização composta pelos melhores detetives. Uma série de detetives com personalidades únicas aparecerá, desde o protagonista de "Detetive Incompetente", até o "Detetive Blindado" vestido de armadura, "Detetive Literário" com uma excelente memória e amor por livros, "Detetive do Submundo" especializado em ocultismo e muito mais. Este caso não pode ser resolvido apenas por um detetive. Durante o jogo, ocorrerão partes de investigação nas quais os detetives investigam. No entanto, o avatar do jogador - o Detetive Incompetente - não tem uma habilidade especial. Portanto, a chave é que o jogador dê instruções detalhadas aos seus colegas detetives confiáveis e faça com que eles realizem a investigação em seu nome.

"Yatsuzakikou" é um assassino em série que matou mais de 100 pessoas e jogou o país no caos. Para pôr fim à sua onda de assassinatos, os melhores membros da "Aliança de Detetives", uma organização composta apenas pelos melhores detetives, lançam uma investigação conjunta. Na mesma época, um estudante comum do ensino médio chamado Wato Houjou, que deseja se tornar um detetive, chega a uma ilha remota onde a Aliança de Detetives está sediada sob a orientação de um homem misterioso chamado "O Detetive Sábio". Na ilha, Wato não conseguiu esconder sua empolgação em conhecer a Aliança de Detetives que tanto admirava. No entanto, quando os detetives suspeitaram que ele era Yatsuzakikou, ele ficou sem palavras. Yatsuzakikou já havia se infiltrado na ilha, e muitos detetives foram assassinados. Para limpar seu nome, Wato e o líder da Aliança de Detetives, o "Detetive Ideal", iniciam uma investigação. 14 detetives permanecem vivos. E Yatsuzakikou está entre eles.