Alien Shooter: The Experiment é o segundo complemento de Alien Shooter. Este novo pacote de expansão adiciona cinco novas missões ao jogo, mas, ao contrário da expansão anterior, também introduz novos campos de jogo, como casas e playgrounds. Esta expansão também adiciona novas armas e novos inimigos, incluindo uma batalha de chefões. Uma adição final que a Equipe Sigma fez, devido à demanda popular dos fãs, é a inclusão de uma seleção de nível de dificuldade mais difícil no início do jogo.